微生物学教研室始建于1938年，自2000年起与寄生虫学教研室共同构建的病原生物学成为省级重点学科，2008年成为二级学科博士授权点，2014年成为贵州省高校病原生物学特色重点实验室，2016年被评为贵阳市科技创新团队，2018年成为贵州省微生物与人类健康人才基地，2019年成为科技部及教育部111计划西南喀斯特区域病原微生物防治学科创新引智基地。承担的主干课程-医学微生物学为贵州省精品课程、贵州省一流课程和贵州省课程思政示范课程。

教研室现有教师12人，包括教授（博导）2人、副教授8人（其中博导1人）、讲师1人、实验员1人，其中博士7人，分别毕业于贵州医科大学、日本千叶大学、四川大学、武汉大学和中科院青岛能源所；教师中有教育部教指委1人、省管专家和享受省政府特殊津贴1人，贵州省高校“金师”1人，贵州省优青1人，千层次人才2人。近年来承担7项国家自然科学基金项目，获得多项奖励和荣誉，包括省科技进步三等奖、全国虚拟实验项目展示活动一等奖、高校微课竞赛三等奖和鼓励奖各1项，以及贵州省巾帼文明岗、贵州省五一巾帼标兵、贵州省教育系统工作表现突出个人等。